環境微生物常被利用於污水處理及污泥處理上，如污水厭氧好氧（Anaerobic/Oxic）程序及污泥厭氧消化（Anaerobic digestion）程序，請說明二者處理程序目的、微生物菌群、環境條件、代謝途徑及操作控制參數等差異。