行政院海岸巡防署及所屬機關與交通部及所屬機關（構）間，於相互請求協助時，應依規定辦理，除緊急情形外，應以書面為之。學理上稱為：

機關間因業務需要相互請求協助，屬平行關係的臨時性協力，學理稱『職務協助』，行政程序法第19條為總則規定，海巡與交通部互助辦法即其具體化。