在臺北市申請經營旅館業，除依法辦妥公司或商業登記外，依發展觀光條例規定並應向那一機關申請登記，領取登記證後，始得營業？

正確。發展觀光條例規定，經營旅館業除完成公司或商業登記外，還要向地方主管機關申請登記後才能營業。臺北市屬直轄市，旅館業的地方主管機關即為臺北市政府。