陳先生申請於屏東市開設乙種旅行業，同時在臺北市及高雄市設立分公司，依據旅行業管理規則之規定，總共應繳納保證金新臺幣多少元？

正確。乙種旅行業本公司保證金為60萬元，每一分公司保證金為15萬元。陳先生在屏東設本公司，另於臺北、高雄各設1家分公司，計算為60＋15＋15＝90萬元。