使用肺內叩擊通氣（intrapulmonary percussive ventilation）最常見的合併症為：

IPV 透過高頻（100-300 次/分）小量氣流持續叩擊肺部與胸壁，病人需配合呼吸，長時間下來胸壁肌肉酸痛與呼吸肌疲乏為最常見合併症。