依領隊人員管理規則之規定，補發領隊人員結業證書，應繳納證書費每件新臺幣幾元？

正確。依領隊人員管理規則相關規定，請領或補發領隊人員結業證書，應繳納證書費每件新臺幣500元。因此若證書遺失而申請補發，仍應繳納500元規費。