設甲、乙二法規效力位階均相同，且甲法規對乙法規所規定之同一事項為特別之規定，乙法規修正後，就該同一事項應適用何法規？

正確。依中央法規標準法第16條，特別法優於普通法；即使普通法（乙）修正後，特別法（甲）仍應優先適用，這是特別法原則的核心。