依照公司法之規定，甲公司若欲申請停止公開發行，應經由公司何一機關之決議？

正解。依公司法第156條之2第1項規定，公司得依董事會之決議向證券主管機關申請辦理公開發行程序；惟「停止公開發行」則須經股東會決議，因其涉及全體股東權益與公司資本結構之重大變動，故屬股東會專屬權限。