在次世代（Next Generation Sequencing）定序實驗中，下列何者係指經由定序實驗所得到的鹼基總量（bp）與基因組（Genome）大小的比值，此數值為評價定序結果的參考指標之一？
ASequencing Depth正確答案
BQuality Score
CCluster
DReads
答案與詳解
A
正確答案
定序深度 (Sequencing Depth) = 定序總鹼基數 ÷ 基因組大小，代表平均每個鹼基被讀取幾次。
為什麼答案是 A
Sequencing Depth (定序深度) 定義為定序所得總鹼基數 (bp) 除以基因組大小，常以 30X、50X 表示，是評估定序覆蓋度與準確性的關鍵指標。
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完整詳解
Pro · 無限重點 定序深度 (Sequencing Depth) = 定序總鹼基數 ÷ 基因組大小，代表平均每個鹼基被讀取幾次。
秒殺技巧
看到「鹼基總量 / 基因組大小」的比值 → 直接選 Sequencing Depth（定序深度，單位為 X，如 30X）。逐選項分析
A✓ 正確
Sequencing Depth (定序深度) 定義為定序所得總鹼基數 (bp) 除以基因組大小，常以 30X、50X 表示，是評估定序覆蓋度與準確性的關鍵指標。
B✕ 陷阱
Quality Score (品質分數，如 Q20、Q30) 是評估單一鹼基判讀正確率的指標 (Phred Score)，與鹼基總量/基因組大小無關。
C✕
Cluster 指 Illumina 定序晶片上由同一 DNA 片段橋式擴增形成的訊號叢集，是定序訊號來源，非比值指標。
D✕ 陷阱
Reads 指定序產生的單一讀序片段 (短序列)，是定序的輸出單位。Reads 總長雖為深度的分子，但 Reads 本身不是比值。
NGS 常見評估指標
| 指標 | 定義 | 用途 | 舉例 |
|---|---|---|---|
| Sequencing Depth | 總鹼基數 ÷ 基因組大小 | 覆蓋度與準確性 | 30X、100X |
| Coverage | 基因組被讀到的比例 | 完整性 | 95% |
| Quality Score | Phred 分數 (-10log10 錯誤率) | 鹼基正確性 | Q30 = 99.9% |
| Reads | 單一定序片段 | 輸出單位 | 150 bp reads |
| Cluster | 晶片上訊號叢集 | 訊號來源 | Illumina 平台 |
陷阱提醒
本題陷阱在於 Reads 看似與「鹼基量」相關，但 Reads 只是單一片段，而比值 (Depth) 才是評估指標。另要區分 Depth (深度) 與 Coverage (覆蓋率) 的不同，兩者常被混用但定義不同。