依地方制度法規定，甲縣建築物施工管理辦法發布後函報中央主管機關，若有牴觸法律部分，中央主管機關應如何處理？

依地方制度法第30條，自治條例或自治規則牴觸憲法、法律、基於法律授權之法規或上級自治團體自治條例者，無效，由上級主管機關函告之。