X法為Y法之特別法，之後Y法修訂，X法並未修訂。Y法修訂後所發生之事件，應如何適用法規？

正確。依中央法規標準法第16條，特別法優於普通法。X法雖未修訂，仍為Y法的特別法，應優先適用X法，X法未規定者才補充適用修訂後Y法。