依司法院大法官解釋，直轄市政府辦理自治事項違背憲法時，依法應如何處理？

對。地方制度法第75條第2項明定，直轄市政府辦理自治事項違背憲法、法律或基於法律授權之法規者，由中央各該主管機關報行政院予以撤銷、變更、廢止或停止其執行。