依司法院大法官解釋，以判決命誹謗之加害人登報向被害人道歉，涉及當事人間何種基本權利之衝突？

對。釋字第656號明確指出，判決命加害人公開道歉涉及憲法第11條言論自由所保障的不表意自由；被害人則是因名譽受侵害而請求回復名譽，因此是「不表意自由」與「名譽權」的衝突。