對原核生物與真核生物而言，DNA 甲基化反應主要分別發生於 DNA 的何種鹼基上？

原核生物由 Dam methylase 在 GATC 序列的 adenine 上加甲基（N6-methyladenine），用於區分自我 DNA 與外來 DNA；真核生物則在 CpG 島的 cytosine C5 加甲基（5-methylcytosine），調控基因表現與 imprinting。