臺灣地區各級學校與大陸地區學校締結聯盟或為書面約定之合作行為，應先向何機關申報？

正確。《臺灣地區與大陸地區人民關係條例》第33條之3明定，臺灣地區各級學校與大陸地區學校締結聯盟或為書面約定合作，應先向教育部申報；教育部才是法定窗口。