香港或澳門居民如有下列情形者，其申請在臺灣居留得不予許可？

正確。香港或澳門居民申請在臺居留時，現或曾在臺灣地區有行方不明紀錄達3個月以上，屬主管機關得不予許可的明文事由。題幹問「得不予許可」，抓到期間門檻「3個月」即可秒選。