甲以其土地與乙的土地與房屋交換，請問契稅之納稅義務人為何人？

正確。甲以自己的土地去交換乙的土地與房屋；其中土地部分在開徵土地增值稅區域免徵契稅，真正要課契稅的是甲所取得的「房屋」。依交換契稅規則，各就承受部分申報納稅，所以承受房屋的甲為納稅義務人。