依土地登記規則規定，某甲土地設定農育權登記後，因存續期間屆滿致權利消滅時，應申請何種登記？

依土地登記規則第143條，他項權利（如農育權、地上權、抵押權等）因存續期間屆滿、混同、拋棄等原因消滅時，應申請塗銷登記，將登記從登記簿上塗除。