專技高考-醫事檢驗師醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學（包括寄生蟲學）105 年第 50 題單選題
下列何種方法無法用來檢測DNA與蛋白質的結合？
ADNA footprinting
BElectrophoretic mobility-shift assay
CChromatin immunoprecipitation
DFluorescence in situ hybridization正確答案
D正確答案
FISH 是用螢光探針偵測特定 DNA/RNA 序列在染色體或細胞中的位置，屬於核酸對核酸的雜交，與蛋白質結合無關。
為什麼答案是 D
FISH 是用螢光標記的核酸探針與目標 DNA/RNA 進行雜交，用來偵測染色體異常、基因定位或 RNA 表現，屬於核酸雜交技術，完全不涉及蛋白質結合分析。
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完整詳解
Pro · 無限重點 FISH 是用螢光探針偵測特定 DNA/RNA 序列在染色體或細胞中的位置，屬於核酸對核酸的雜交，與蛋白質結合無關。
看到「in situ hybridization」就想到核酸雜交（DNA-DNA 或 DNA-RNA），不涉及蛋白質。
逐選項分析
A✕
DNA footprinting 利用蛋白質結合保護 DNA 不被 DNase I 切割，從電泳圖譜上「空白區」判斷蛋白質結合位置，是經典 DNA-蛋白質互動研究方法。
B✕
EMSA（凝膠遲滯分析）原理：DNA 與蛋白質結合後分子量變大，在膠體上跑得較慢產生 shift band，可定性判斷有無結合，是檢測 DNA-蛋白質結合的標準方法。
C✕
ChIP（染色質免疫沉澱）用抗體拉下目標蛋白質連同其結合的 DNA 片段，再分析 DNA 序列，是研究體內 DNA-蛋白質結合最重要的方法。
D✓ 正確
FISH 是用螢光標記的核酸探針與目標 DNA/RNA 進行雜交，用來偵測染色體異常、基因定位或 RNA 表現，屬於核酸雜交技術，完全不涉及蛋白質結合分析。
DNA-蛋白質結合檢測方法總覽
| 方法 | 原理 | 用途 | 是否測蛋白結合 |
|---|
| DNA footprinting | 蛋白保護 DNA 不被 DNase 切 | 找結合位點序列 | ✅ 是 |
| EMSA | 結合後膠體電泳遲滯 | 定性 DNA-蛋白結合 | ✅ 是 |
| ChIP | 抗體沉澱蛋白拉下 DNA | 體內結合位點分析 | ✅ 是 |
| FISH | 螢光探針雜交核酸 | 染色體/基因定位 | ❌ 否 |
FISH 名字中有「hybridization」雜交，容易誤以為跟蛋白質有關，但其實雜交對象是核酸序列。題目要找「無法檢測蛋白結合」的方法，FISH 完全不沾邊蛋白質，是唯一答案。
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