方案教學中常會利用主題網，如果將方案教學和主題教學作區分，主要的差別在於：

方案教學強調學生主動提出問題、規劃並執行探究，學生的自主程度高；主題教學的主題與活動多由教師預先規劃，學生自主程度較低，這是兩者主要的差別。