勞動部管轄工資、工作時間、休息之業務是由下列何一單位主掌？

正解。勞動部組織法下設「勞動條件及就業平等司」，掌管工資、工時、休息、休假、請假、性別工作平等等業務，是勞基法核心執行單位。