A 公寓大廈規約約定區分所有權人不得養狗，新搬進的區分所有權人甲不願意遵守，是否有理由？

正確。依公寓大廈管理條例，規約對繼受人（後手買受人）亦有拘束力，甲買受後當然繼受原規約所定事項，包括禁養寵物之約定。