流產小豬可見全身臟器多發性壞死，肝細胞內有嗜酸性核內包含體，最可能的病原為：

豬假性狂犬病病毒（Pseudorabies / Aujeszky's disease）屬於疱疹病毒科，可造成流產死胎與全身多發性壞死病灶，肝、脾常見壞死，並出現典型的嗜酸性核內包含體（Cowdry type A），完全符合題幹描述。