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專技高考-醫事檢驗師醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學(包括寄生蟲學)11354單選題

由全轉錄體定序(whole transcriptome sequencing)產出用於敘述各個基因產物豐度的 fragments per kilobase of transcript per million mapped reads(FPKM)值,最不會受到下列那個因子的影響?

A定序基因產物的長度
B可正確比對至定序基因產物的讀長數(mapped reads)
C定序讀長正確答案
D定序深度(reading depth)
答案與詳解
C
正確答案
FPKM 已對「基因長度」與「定序總讀長數(百萬)」做標準化,但讀長本身的長度(read length)並不直接進入計算公式,故最不受影響。

為什麼答案是 C

「定序讀長(read length)」指每條 read 的鹼基長度,不是 FPKM 公式中的任一參數。FPKM 只看基因長度與總比對讀數(百萬),故最不會受單條讀長影響,為正解。

考點:基因長度標準化考點:mapped reads 數考點:read length 不入公式考點:定序深度
載入中…

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