專技高考-醫事檢驗師醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學(包括寄生蟲學)113 年第 60 題單選題
下圖為次世代定序產出的序列比對結果,此為正股序列;若箭號處為發生基因變異的位點,則此位點產生了那種突變?
B正確答案
NGS比對圖中箭號位點,Reference為C,但多數reads顯示T,正股序列故為C>T突變
為什麼答案是 B
Reference seq箭號位置為C(參考序列底部可見),但NGS reads在該位點大多數顯示T,故突變為C>T(原始→突變),正確答案
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完整詳解
Pro · 無限重點 NGS比對圖中箭號位點,Reference為C,但多數reads顯示T,正股序列故為C>T突變
先看Reference seq箭號位置的鹼基=C;再數reads該位點最多出現的鹼基=T;正股序列直接讀,答案為C>T
逐選項分析
A✕ 陷阱
T>C是將T變成C,但本題Reference是C,reads多數是T,方向相反,這是陷阱選項
B✓ 正確
Reference seq箭號位置為C(參考序列底部可見),但NGS reads在該位點大多數顯示T,故突變為C>T(原始→突變),正確答案
C✕
A>G與本題位點無關,圖中箭號位置Reference為C非A,reads亦非G,排除
D✕
G>A與本題位點不符,Reference箭號處為C非G,讀取結果亦非A為主,排除
NGS序列比對突變判讀步驟
| 步驟 | 操作說明 | 本題結果 |
|---|
| Step 1 | 找到箭號指示的變異位點欄位 | 圖中上方箭頭對應的直行 |
| Step 2 | 查看Reference seq該位點鹼基 | Reference = C |
| Step 3 | 統計NGS reads該位點最常見鹼基 | 多數reads = T |
| Step 4 | 寫出突變型式(Reference>Variant) | C > T |
| Step 5 | 確認正/負股(題目已說正股) | 正股直接讀,無需互補轉換 |
最常見陷阱有二:①方向顛倒:把Variant>Reference誤寫成T>C(選A);②正負股混淆:若誤以為需互補轉換則得G>A(選D)。本題明確說明「正股序列」,因此直接讀取Reference=C、Reads=T,突變為C>T,無需任何轉換。
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