臺灣鹿隻最需特別注意的人畜共通傳染病為：

鹿結核病由 Mycobacterium bovis 引起，臺灣養鹿產業最頭痛的疾病。鹿茸、鹿肉、生乳都可能成為傳染媒介，臺灣已將其列為甲類動物傳染病監控對象。