專技高考-醫事檢驗師醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學（包括寄生蟲學）106 年第 47 題單選題
最常用於檢測表觀基因調控（Epigenetic regulation）狀態的方法為何？
ADNA sequencing
BMethylation PCR正確答案
CSouthern hybridization
DDNA footprinting
B正確答案
表觀遺傳調控最核心機制是 DNA 甲基化，故甲基化 PCR 為首選檢測方法。
為什麼答案是 B
Methylation-specific PCR (MSP) 透過 bisulfite 處理使未甲基化的 C 轉為 U，再用特異性引子擴增，可快速、靈敏、低成本地檢測 CpG 島甲基化狀態，臨床最常用。
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完整詳解
Pro · 無限重點 表觀遺傳調控最核心機制是 DNA 甲基化，故甲基化 PCR 為首選檢測方法。
看到 Epigenetic → 直接聯想 DNA methylation → 選 Methylation PCR。
逐選項分析
A✕ 陷阱
一般 DNA sequencing 只能讀取鹼基序列 A/T/C/G，無法區分 cytosine 是否被甲基化。需經 bisulfite 處理後才能定序甲基化狀態，故非「最常用」方法。
B✓ 正確
Methylation-specific PCR (MSP) 透過 bisulfite 處理使未甲基化的 C 轉為 U，再用特異性引子擴增，可快速、靈敏、低成本地檢測 CpG 島甲基化狀態，臨床最常用。
C✕
Southern hybridization 用於偵測特定 DNA 片段大小或基因重組、缺失，雖搭配甲基化敏感限制酶可分析甲基化，但操作繁瑣、靈敏度低，非主流方法。
D✕
DNA footprinting 是用來偵測蛋白質與 DNA 結合位點（protein-DNA interaction）的技術，與表觀遺傳甲基化檢測無直接關聯。
表觀遺傳檢測方法對照
| 方法 | 原理 | 用途 | 常用度 |
|---|
| Methylation PCR | Bisulfite + 特異引子 | CpG 甲基化 | ★★★★★ |
| Bisulfite sequencing | 處理後定序 | 單鹼基甲基化 | ★★★★ |
| ChIP-seq | 抗體拉染色質 | 組蛋白修飾 | ★★★★ |
| DNA footprinting | DNase 切割 | 蛋白結合位 | 與表觀無關 |
考生易誤選 A (DNA sequencing)，但一般定序無法分辨甲基化 cytosine。表觀遺傳的核心是「修飾」而非「序列改變」，故必須用甲基化專屬技術 (MSP) 才能偵測。
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