專技高考-醫事檢驗師醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學（包括寄生蟲學）110 年第 44 題單選題
偵測single nucleotide polymorphism（SNP）的方法，下列何者是以雜交反應（Hybridization）為基礎的技術？
A雙去氧核糖核酸指紋分析（Dideoxy DNA fingerprinting）
B單股DNA截斷分析法（Single-strand DNA truncation assay）
CSNP DNA 晶片分析正確答案
D聚合酶連鎖反應－限制酶片段長度多型性（PCR-RFLP）
C正確答案
SNP DNA 晶片（microarray）是把已知探針固定在晶片上，靠待測DNA與探針互補雜交來判讀基因型，屬於以Hybridization為基礎的技術。
為什麼答案是 C
SNP DNA晶片在固相表面放置大量已知序列的對偶基因專一性寡核苷酸探針，待測標記DNA與探針互補配對（雜交）後讀取訊號判定基因型，完全是以Hybridization為基礎，正解。
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完整詳解
Pro · 無限重點 SNP DNA 晶片（microarray）是把已知探針固定在晶片上，靠待測DNA與探針互補雜交來判讀基因型，屬於以Hybridization為基礎的技術。
看到「晶片(chip/array)」幾乎都跟雜交綁在一起，直接選晶片就對。
逐選項分析
A✕
雙去氧定序為基礎的指紋分析屬於序列分析（sequencing），靠ddNTP終止鏈延長後做電泳分離，不是以雜交反應判讀，故非以Hybridization為基礎。
B✕
單股DNA截斷／構型分析（如SSCP概念）是利用單股DNA的二級構型差異在電泳中移動率不同來判別突變，屬於電泳構型分析，不是雜交技術。
C✓ 正確
SNP DNA晶片在固相表面放置大量已知序列的對偶基因專一性寡核苷酸探針，待測標記DNA與探針互補配對（雜交）後讀取訊號判定基因型，完全是以Hybridization為基礎，正解。
D✕ 陷阱
PCR-RFLP是先PCR擴增再用限制酶切割，依片段長度差異（電泳）判斷SNP是否改變酶切位，屬於酶切＋電泳，不是雜交技術，常被誤認為分子檢驗就是雜交而設陷阱。
SNP 偵測方法分類
| 方法 | 原理基礎 | 是否雜交 | 判讀方式 |
|---|
| SNP DNA晶片 | 探針互補配對 | 是 | 螢光訊號 |
| PCR-RFLP | 限制酶切割 | 否 | 電泳片段長度 |
| 定序/指紋 | 鏈終止定序 | 否 | 序列電泳 |
| SSCP/截斷分析 | 單股構型差異 | 否 | 電泳移動率 |
考生常以為「分子檢驗都靠雜交」而誤選PCR-RFLP。其實RFLP是限制酶切割＋電泳分析片段長度，與雜交無關。真正以雜交判讀基因型的是固相探針的DNA晶片，務必分清原理。
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