在變性梯度膠體電泳法(Denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE)中,通常要在其中一條PCR引子的 5' 端接上何種結構的分子,以避免在高濃度的變性劑存在下,所有的DNA皆變成單股?
AGC clamp正確答案
BAT clamp
CPoly-A
D5' cap
答案與詳解
GC clamp 是一段約 30-50 bp 的高 GC 含量序列(通常 GC 含量 >50%),接在 PCR 引子 5' 端。因 G-C 配對有 3 個氫鍵,熔點極高,在高濃度變性劑下仍能保持雙股,避免 DNA 完全變性,使 DGGE 能依序列差異呈現不同遷移位置。
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