專技高考-醫事檢驗師醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學(包括寄生蟲學)110 年第 72 題單選題
焦磷酸定序(pyrosequencing)是一種廣泛應用於腫瘤突變檢測的技術,其優點為引子延伸反應和定序同時進行,可免去電泳的步驟。下圖為一焦磷酸定序的結果,關於標的片段的DNA序列,下列何者正確?
AAGTGCTGTG
BAGTCAGTCAGTCAGTCAG
CAGGGGTGGCTTTGGGGTTG正確答案
DGGGGTTGGGT
C正確答案
焦磷酸定序的pyrogram峰高代表連續相同核苷酸的數量,需依峰高比例還原實際DNA序列,本題答案為AGGGGTGGCTTTGGGGTTG。
為什麼答案是 C
AGGGGTGGCTTTGGGGTTG:A(1個)→G(4個)→T(1個)→G(2個)→C(1個)→T(3個)→G(4個)→T(2個)→G(1個)。依圖從左到右:第1循環A峰≈25(1個A),G峰≈100(4個G),T峰≈25(1個T),G峰≈50(2個G),C峰≈25(1個C),T峰≈75(3個T),G峰≈100(4個G),T峰≈50(2個T),G峰≈25(1個G)。對應峰高依序與序列吻合,是唯一符合所有峰高比例的答案。
載入中…
完整詳解
Pro · 無限重點 焦磷酸定序的pyrogram峰高代表連續相同核苷酸的數量,需依峰高比例還原實際DNA序列,本題答案為AGGGGTGGCTTTGGGGTTG。
每個循環依A→G→T→C順序加入dNTP,峰高與連續相同鹼基數成正比(峰高~100為4個,~75為3個,~50為2個,~25為1個),逐一讀出即可還原序列。
逐選項分析
A✕
AGTGCTGTG序列太短且峰型簡單,無法產生圖中觀察到的多種高度峰值組合,不符合圖中複雜的峰高分佈。
B✕ 陷阱
AGTCAGTCAGTCAGTCAG為完全重複序列,每個鹼基峰高應全部相等(均為~25),但圖中明顯出現高低不一的峰,排除此選項。
C✓ 正確
AGGGGTGGCTTTGGGGTTG:A(1個)→G(4個)→T(1個)→G(2個)→C(1個)→T(3個)→G(4個)→T(2個)→G(1個)。依圖從左到右:第1循環A峰≈25(1個A),G峰≈100(4個G),T峰≈25(1個T),G峰≈50(2個G),C峰≈25(1個C),T峰≈75(3個T),G峰≈100(4個G),T峰≈50(2個T),G峰≈25(1個G)。對應峰高依序與序列吻合,是唯一符合所有峰高比例的答案。
D✕
GGGGTTGGGT序列不含A鹼基在首位,且長度僅10個鹼基,與圖中第一峰出現在A位置且有較多循環的訊號不符。
焦磷酸定序峰高與連續鹼基數對照
| 連續相同鹼基數 | 相對峰高(約) | 圖中對應範例 |
|---|
| 1個 | ~25 | 第1循環A峰、T峰單一鹼基 |
| 2個 | ~50 | GG、TT等雙鹼基段 |
| 3個 | ~75 | TTT等三鹼基段 |
| 4個 | ~100 | GGGG等四鹼基段(圖中最高峰) |
最常見陷阱是把pyrogram每個峰都當作「1個鹼基」來讀,誤選B(AGTCAGTCAGTCAGTCAG)。正確觀念是:峰高成比例反映連續相同鹼基數,峰高加倍代表連續2個相同鹼基,必須依峰高還原實際鹼基數量才能得出正確序列。
醫學分子檢驗學與臨床鏡檢學(包括寄生蟲學) 相關題目